Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltn1Q6A009 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltn1Q6A009 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms