Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc2Q69ZB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms