Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk13Q69ZA1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk13Q69ZA1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk13Q69ZA1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms