Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgefl1Q68EF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms