Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3ipQ68EF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms