Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt12Q64291 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms