Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlh2Q64221 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms