Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcf2lQ64096 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcf2lQ64096 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcf2lQ64096 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcf2lQ64096 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcf2lQ64096 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mcf2lQ64096 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcf2lQ64096 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcf2lQ64096 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms