Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps72Q62481 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps72Q62481 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps72Q62481 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms