Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3gl2Q62420 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms