Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52Q62393 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tpd52Q62393 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52Q62393 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms