Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sprr1bQ62267 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sprr1bQ62267 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms