Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Six2Q62232 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six2Q62232 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms