Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tgfb1i1Q62219 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb1i1Q62219 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms