Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sema3cQ62181 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3cQ62181 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms