Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3bQ62141 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms