Protein–RNA interactions for Protein: Q61765

Krt31, Keratin, type I cuticular Ha1, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt31Q61765 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt31Q61765 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt31Q61765 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt31Q61765 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms