Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna11Q61716 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna11Q61716 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna11Q61716 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms