Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HlxQ61670 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HlxQ61670 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HlxQ61670 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HlxQ61670 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HlxQ61670 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms