Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EsrrbQ61539 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EsrrbQ61539 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms