Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd55bQ61476 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd55bQ61476 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms