Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms