Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfap2bQ61313 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2bQ61313 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms