Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf9Q61179 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Irf9Q61179 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irf9Q61179 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irf9Q61179 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms