Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms