Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JrkQ60976 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrkQ60976 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrkQ60976 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms