Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbc1d1Q60949 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d1Q60949 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms