Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctf1Q60753 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctf1Q60753 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms