Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha1Q60715 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha1Q60715 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha1Q60715 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms