Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf123Q5XPI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf123Q5XPI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms