Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rabl6Q5U3K5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms