Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Utp18Q5SSI6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp18Q5SSI6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms