Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm11487Q5RIS0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm11487Q5RIS0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms