Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms