Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb3Q571F5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms