Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr4Q501J7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phactr4Q501J7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr4Q501J7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms