Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1qtnf9Q4ZJN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms