Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srek1ip1Q4V9W2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srek1ip1Q4V9W2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srek1ip1Q4V9W2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms