Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6040Q4QY32 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6040Q4QY32 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6040Q4QY32 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms