Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms