Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
6430531B16RikQ3V2J1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms