Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmub2Q3V209 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmub2Q3V209 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms