Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933427I04RikQ3V053 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933427I04RikQ3V053 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933427I04RikQ3V053 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4933427I04RikQ3V053 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms