Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3l2Q3UXB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms