Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prom2Q3UUY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prom2Q3UUY6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms