Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms