Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cracr2aQ3UP38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2aQ3UP38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms