Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r12cQ3UMT1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms