Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrch2Q3UMG5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrch2Q3UMG5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms