Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cobll1Q3UMF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms